Не работают ярлыки рабочего стола. Не работают системные( пуск, поиск, громкость, смена языка и т.д)
Работают только программы, которые там появляются или были закреплены. 

Решение:

В командной строке от имени от имени администратора запустите поочередно следующие команды и дождитесь их выполнения:
sfc /scannow
Dism /Online /Cleanup-Image /RestoreHealth                         
 
Как запустить командную строку от имени администратора: Нажмите сочетание клавиш CTRL+SHIFT+ESC и откроется Диспетчер задач. Далее на самом верху Файл> Запустить новую задачу, поставить галочку возле параметра Создать задачу с правами администратора и введите CMD, далее ОК
 
 
Также попробуйте провести следующие рекомендации (во время их проведения все приложения должны быть закрыты!!!):
1. Нажмите сочетание клавиш CTRL + ALT + DEL и нажмите "Диспетчер задач".
2. В верхнем меню "Диспетчера задач" нажмите "Файл - Запустить новую задачу".
3. В появившемся окне введите Powershell, поставьте галочку "Создать задачу с правами администратора", и нажмите "ОК".
4. В появившемся окне имеется командная строка. Ничего в ней не трогая, копируем отсюда данный код:

Get-AppXPackage -AllUsers | Foreach {Add-AppxPackage -DisableDevelopmentMode -Register “$($_.InstallLocation)\AppXManifest.xml”}

5. Переключаемся на открытое голубое окно, затем вставляем вышеуказанный код комбинацией клавиш CTRL + V, и нажимаем Enter на клавиатуре.
6. Дожидаемся окончания процесса выполнения команды (строка вернется в исходное положение), и перезагружаем компьютер.