Преобразование файловой системы FAT32 в NTFS без потери данных можно выполнить и штатными средствами операционной системы,
используя утилиту convert.exe (File System Conversion Utility):

кнопка Пуск - Выполнить… - Запуск программы - cmd - Enter. 
Запустится командный интерпретатор cmd.exe. 
После приглашения системы C: \Documents and Settings\Имя_пользователя> надо ввести команду CONVERT том: /FS:NTFS [/NoSecurity] [/X] здесь том - определяет букву диска (с последующим двоеточием), /FS:NTFS - конечная файловая система: NTFS. /NoSecurity - параметры безопасности для преобразуемых файлов и папок будут доступны для изменения всем. /X - принудительное снятие этого тома (если он был подключен). Все открытые дескрипторы этого тома станут недопустимыми. 

Например, если требуется конвертировать диск C:, то нужно ввести CONVERT C: /FS:NTFS /NoSecurity /X

Иногда система просит: Введите текущий метку тома для диска X: (Enter current volume label for Drive X:)
Что такое метка тома? What is the volume label? На рисунке ниже я показал о чём идёт речь

Примечания:
 - Поскольку конвертирование файловой системы потенциально опасно (в случае каких-либо сбоев, например, если произойдет сбой по питанию, Вы можете утратить доступ к своим файлам), если Вы не чувствуете себя достаточно подготовленным, - обратитесь к специалистам! 
Внимание! Хотя вышеуказанные методы позволяют конвертировать FAT32 в NTFS без потери данных, желательно сначала скопировать свои данные на другой носитель.